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Research Cooperation

科研合作

遺傳性腫瘤基因Panel(高通量測序法)

背景簡介

      我國每年新發(fā)腫瘤患者約457萬例,其中家族遺傳性腫瘤約5%~10%[1]。已經(jīng)發(fā)現(xiàn)超過100個基因具有遺傳易感性,其中大部分為腫瘤抑制基因[2]。遺傳性腫瘤大多數(shù)為常染色體顯性遺傳,上一代的致病基因突變遺傳給后代的概率一般為50%,因此遺傳性腫瘤常具有家族聚集的特點(diǎn)。對遺傳性腫瘤基因進(jìn)行檢測,明確個體是否攜帶相關(guān)致病突變,對腫瘤患者而言可以選擇針對性的治療方案,評估罹患其他腫瘤的風(fēng)險(xiǎn)。對于高風(fēng)險(xiǎn)人群,可以評估患癌風(fēng)險(xiǎn),并以此制定可行的風(fēng)險(xiǎn)管理方案,實(shí)現(xiàn)腫瘤的早篩査、早發(fā)現(xiàn)、早干預(yù)、早治療。

遺傳性腫瘤的遺傳模式圖


常見的遺傳性腫瘤

      國內(nèi)最常見的家族遺傳性腫瘤涵蓋乳腺癌、卵巢癌、胃癌、結(jié)直腸癌、甲狀腺癌、腎癌和前列腺癌7個癌種,如MMR基因胚系突變導(dǎo)致林奇綜合征,與遺傳性結(jié)直腸癌等相關(guān);HRR基因突變與遺傳性乳腺癌卵巢癌綜合征(HBOC)、遺傳性前列腺癌等相關(guān)。中國抗癌協(xié)會家族遺傳性腫瘤專業(yè)委員會為這7個癌種分別制定了遺傳性腫瘤臨床診療專家共識[1]。除此之外,胰腺癌、食管癌、胃腸道間質(zhì)瘤、子宮內(nèi)膜癌、尿路上皮癌、黑色素瘤等癌種也有一定的遺傳性。

HBOC的風(fēng)險(xiǎn)管理[3]


癌種列表

檢測20種遺傳性腫瘤相關(guān)的58個基因,其中女性19種腫瘤,男性18種腫瘤,見下表:

結(jié)直腸癌腎癌甲狀腺癌多發(fā)性內(nèi)分泌腺瘤
胃癌
尿路上皮癌黑色素瘤視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤
胰腺癌卵巢癌(女)胃腸道間質(zhì)瘤多發(fā)性骨軟骨瘤
食管癌子宮內(nèi)膜癌(女)結(jié)節(jié)硬化癥多發(fā)性神經(jīng)纖維瘤
乳腺癌前列腺癌(男)家族性腎母細(xì)胞瘤家族性副神經(jīng)節(jié)瘤


檢測項(xiàng)目

項(xiàng)目名稱核心技術(shù)項(xiàng)目規(guī)格適配平臺樣本類型

遺傳性腫瘤基因

Panel

探針捕獲+高通量測序

24人份/套

Illumina

MGISEQ

外周血



檢測意義

腫瘤患者腫瘤患者親屬或健康人群

1、查找致病基因,提供針對性治療方案;

2、提示腫瘤預(yù)后,預(yù)測罹患其他腫瘤的概率;

3、為親屬提供有效的遺傳信息。

1、提示遺傳性腫瘤綜合征的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn);

2、篩選高風(fēng)險(xiǎn)人群,加強(qiáng)后續(xù)健康管理。



優(yōu)勢特點(diǎn)

1、檢測全面:一次性檢測20種遺傳性腫瘤相關(guān)的58個基因,覆蓋常見遺傳性腫瘤綜合征。

2、覆蓋面廣:覆蓋基因的全CDs區(qū),檢測單核苷酸變異(SNV)、拷貝數(shù)變異(CNV)、小片段插入缺失變異(InDels)等突變類型。

3、質(zhì)控嚴(yán)格:在核酸提取、文庫制備、下機(jī)數(shù)據(jù)等多個環(huán)節(jié)設(shè)定了嚴(yán)格的質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)。

4、兼容性強(qiáng):Illumina、華大平臺均適配。



檢測流程

1、核酸提取

2、文庫構(gòu)建

3、上機(jī)測序

4、一鍵式數(shù)據(jù)分析

5、出具報(bào)告


服務(wù)流程

1、咨詢相關(guān)事項(xiàng)(0592-7578309)

2、進(jìn)行樣本取樣

3、樣本快遞至飛朔檢測點(diǎn)

4、上機(jī)檢測

5、出具報(bào)告

6、報(bào)告送出

7、提供專業(yè)咨詢和疑問解答


參考文獻(xiàn)


[1] 中國家族遺傳性腫瘤臨床診療專家共識(2021年版)—家族遺傳性乳腺癌

[2] Nature. 2014 Jan 16;505(7483):302-8.

[3] Nat Rev Cancer. 2016 Sep; 16(9): 599-612.



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